Hướng dẫn thủ tục nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan từ 07/08/2025?

Ngày 24/06/2025, Bộ Tài chính ban hành Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định thủ tục về giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh và phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh.

Theo đó, tại Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định về thủ tục nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan như sau:

Quy trình lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước

Theo khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định để nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan, người nộp thuế cần thực hiện các bước lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước như sau:

Truy cập và tra cứu thông tin

- Người nộp thuế truy cập vào Cổng thanh toán điện tử hải quan tại địa chỉ: https://epayment.customs.gov.vn để tra cứu thông tin khoản phải nộp và lựa chọn khoản nộp ngân sách nhà nước, hệ thống hỗ trợ lập giấy nộp tiền vào ngân sách nhà nước theo mẫu ban hành kèm theo Nghị định 11/2020/NĐ-CP.

- Người nộp thuế kiểm tra thông tin trên chứng từ nộp ngân sách nhà nước, lựa chọn ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước và ký số để yêu cầu trích tiền nộp ngân sách nhà nước.

+ Trường hợp tiền thuế phải nộp vào tài khoản thu khác nhau, thì lập riêng giấy nộp tiền vào ngân sách nhà nước tương ứng với từng tài khoản thu;

Lập chứng từ cho khoản chưa có sẵn

- Đối với khoản nộp chưa có trên Cổng thanh toán điện tử hải quan mà người nộp thuế lựa chọn lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước, người nộp thuế lập đầy đủ thông tin trên chứng từ nộp ngân sách nhà nước, lựa chọn ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước và ký số để yêu cầu trích tiền nộp ngân sách nhà nước;

Nộp phí cho nhiều tờ khai

- Trường hợp người nộp thuế nộp tiền phí hải quan, lệ phí hàng hóa, phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, người nộp thuế cập nhật thông tin số tờ khai đại diện 9999999999 (10 số 9), tổng số tiền phí, lệ phí phải nộp trên giấy nộp tiền vào ngân sách nhà nước và ký số để yêu cầu ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước trích tiền nộp ngân sách nhà nước.

Lưu ý: Doanh nghiệp cần chuẩn bị chữ ký số hợp lệ để thực hiện các thao tác trên Cổng thanh toán điện tử hải quan.

Hướng dẫn thủ tục nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan từ 07/08/2025? (Hình ảnh Internet)

Xử lý và kiểm tra chứng từ nộp ngân sách nhà nước lập trên Cổng thanh toán điện tử hải quan

Theo khoản 2, khoản 3 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định việc xử lý và kiểm tra chứng từ nộp ngân sách nhà nước lập trên Cổng thanh toán điện tử hải quan như sau:

- Xử lý chứng từ nộp ngân sách nhà nước:

+ Cổng thanh toán điện tử hải quan tự động tạo số hoặc mã vạch trên chứng từ nộp ngân sách nhà nước và truyền thông tin nộp ngân sách nhà nước đến ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước nơi người nộp thuế lựa chọn trích tiền;

+ Khi nhận thông tin chứng từ nộp ngân sách nhà nước, ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán thực hiện trích chuyển tiền vào tài khoản của Kho bạc Nhà nước mở tại ngân hàng ủy nhiệm thu theo quy định tại Điều 56 Luật Quản lý thuế 2019 và truyền ngay dữ liệu thông tin thu đến Cổng thanh toán điện tử hải quan; cấp chứng từ nộp ngân sách nhà nước cho người nộp thuế ngay sau khi thực hiện thành công việc trích tiền nộp ngân sách nhà nước.

++ Trường hợp không thể hoàn tất thủ tục trong ngày giao dịch, ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán thực hiện chuyển trước 10 giờ ngày giao dịch tiếp theo.

++ Đối với ngày làm việc cuối cùng của năm phải phối hợp với ngân hàng ủy nhiệm thu để hạch toán và truyền chứng từ ngay trong ngày làm việc cuối cùng của năm;

+ Khi nhận thông tin chứng từ nộp ngân sách nhà nước, Kho bạc Nhà nước thực hiện trích chuyển tiền vào tài khoản thu ngân sách nhà nước và truyền ngay dữ liệu thông tin thu đến Cổng thanh toán điện tử hải quan;

+ Trường hợp tài khoản mà người nộp thuế lựa chọn để trích tiền không đủ để trích nợ hoặc chưa phù hợp các thông tin liên quan, ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước phản hồi thông tin đến người nộp thuế để chỉnh sửa, bổ sung và gửi phản hồi thông tin đến Cổng thanh toán điện tử hải quan về yêu cầu trích tiền không thành công.

- Kiểm tra thông tin chứng từ nộp ngân sách nhà nước:

Do ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước gửi qua Cổng thanh toán điện tử hải quan

+ Cổng thanh toán điện tử hải quan tự động đối soát thông tin nộp ngân sách nhà nước do ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước gửi đến với thông tin người nộp thuế đã lập theo quy định tại Khoản 1 Điều này;

++ Trường hợp đúng với thông tin đã lập thì hệ thống kế toán thuế tập trung của cơ quan hải quan tự động hạch toán thanh khoản nợ, xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, tính tiền chậm nộp (nếu có) theo quy định.

++ Trường hợp người nộp thuế nộp phí hải quan, lệ phí hàng hóa, phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, hệ thống kế toán thuế tập trung sẽ tự động trừ lùi số tiền phí, lệ phí phải thu theo nguyên tắc tờ khai có thời gian nợ phí, lệ phí xa nhất sẽ được trừ nợ trước;

+ Trường hợp thông tin nộp ngân sách nhà nước do ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước gửi qua Cổng thanh toán điện tử hải quan có sai, sót, Cổng thanh toán điện tử hải quan thông báo mã lỗi cho ngân hàng, tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước và từ chối cập nhật thông tin nộp tiền vào hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan.

++ Sau khi ngân hàng, tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước đã chỉnh, sửa thông tin phù hợp, hệ thống kế toán thuế tập trung của cơ quan hải quan tự động hạch toán thanh khoản nợ, xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, tính tiền chậm nộp (nếu có) theo quy định.

Hoàn tất hạch toán và thông quan hàng hóa

Theo khoản 4, khoản 5 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định về hoàn tất hạch toán và thông quan hàng hóa như sau:

- Hạch toán tại kho bạc nhà nước: đối với thông tin chuyển tiền do ngân hàng ủy nhiệm thu chuyển đến, Kho bạc Nhà nước thực hiện hạch toán kế toán số tiền phát sinh vào tài khoản thu ngân sách nhà nước theo quy định của pháp luật về ngân sách nhà nước, đồng then truyền bảng kê chứng từ nộp ngân sách nhà nước cho cơ quan hải quan theo quy định.

- Thông quan hàng hóa: Sau khi nhận được thông tin hạch toán thu nộp tiền thuế do Kho bạc Nhà nước gửi đến qua trung tâm dữ liệu của Bộ Tài chính, hệ thống kế toán thuế tập trung của cơ quan hải quan cập nhật thông tin và hạch toán kế toán thanh toán với ngân sách nhà nước theo quy định.

Lưu ý: Trường hợp hệ thống đường truyền có sự cố, các đơn vị xử lý theo quy định tại Điều 15 Thông tư 51/2025/TT-BTC

Trên đây là toàn bộ thông tin về "Hướng dẫn thủ tục nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan từ 07/08/2025?"

Xem thêm

• Hướng dẫn tải iTaxViewer 2.4.9 phần mềm đọc tờ khai thuế XML mới nhất 2025
• Thẩm quyền xử phạt vi phạm hành chính của Hải quan từ 1/7/2025 như thế nào?
• Thay đổi đối tượng phải làm thủ tục hải quan, chịu sự kiểm tra, giám sát hải quan từ 15/8/2025